6 сентября 2016 года указом губернатора было образовано главное контрольное управление Севастополя. В связи с десятилетием со дня создания исполнительного органа состоялось торжественное мероприятие.
В мероприятии приняли участие заместитель губернатора Светлана Пирогова, депутаты Законодательного Собрания Вячеслав Аксенов и Сергей Колбин, председатель счетной палаты Юлия Кокарева, руководитель управления Федерального казначейства Татьяна Панфилова, заместитель прокурора Севастополя Евгений Кадамов, заместитель руководителя Межрегионального управления Федеральной антимонопольной службы по Республике Крым и Севастополю Вугар Мехтиев. Сотрудникам вручили награды от губернатора, председателя Законодательного Собрания и департамента финансов.
За 10 лет работы управление провело более 245 контрольных и аналитических мероприятий. Только в 2025 году объем проверенных средств составил порядка 8 млрд рублей. По итогам 2025 года управление одержало победу на X Всероссийском конкурсе «Лучший орган внутреннего государственного (муниципального) финансового контроля» в номинации «Реализация результатов контрольной деятельности», заняв первое место.
Управление также выполняет важную роль в координации совершенствования государственного контроля (надзора) в Севастополе, направленной на внедрение Федерального закона № 248-ФЗ, снижение административной нагрузки на бизнес и повышение инвестиционной привлекательности региона. Благодаря риск-ориентированному подходу и работе в рамках 248-ФЗ Севастополь второй год подряд признан лидером в Южном федеральном округе по эффективности контрольной (надзорной) деятельности и входит в десятку лучших регионов России.
В текущем году приоритетным направлением является развитие цифровых форматов контроля: увеличение доли дистанционных проверок с использованием мобильного приложения «Инспектор», внедрение искусственного интеллекта в контрольную деятельность.
Кроме того, управление активно взаимодействует с другими контрольно-надзорными органами. На мероприятии руководители счетной палаты, Межрегионального управления Федеральной антимонопольной службы по Республике Крым и Севастополю, главного контрольного управления и управления Федерального казначейства договорились о создании сборника методических материалов для исполнительных органов, где на основе проведенных проверок будут указаны типовые ошибки в финансовой сфере и в сфере контрольно-надзорной деятельности в целях профилактики возможных нарушений.